Potrebbe essere un modo non corretto di usare IDE...
I file indicalti con "header.h", devono essere FISICAMENTE presenti nella cartella del progetto assieme al file main, aggiungendo un file al progetto, non è detto che questo venga inserito nella cartella del progetto, quindi in esecuzione non lo trova.

Per verificare, apri la cartella progetto, e guarda se i tuoi file sono presenti assieme al main, se non è cosi, fai un copia incolla dei file.