un conto è fare un ecommerce con qualche prodotto, slegato da tutto.
un conto è fare un ecommerce / b2b legato al proprio gestionale.
sono due cose molto differenti (lo dico per esperienza personale).
il problema non è tanto mettere su l'ecommerce base.
ne ho visti parecchi che ci sono riusciti con i vari CMS.
il problema vero si presenterà quando si renderà conto che avrà bisogno di interfacciarsi col suo gestionale (a partire dall'inserimento / aggiornamento anagrafiche).
o quando gli verranno fatte richieste più approfondite, e non saprà dove mettere le mani.
però, se non hai pretese, e sei ben consapevole di tutto ciò, inizia col provare i vari CMS.
io con wordpress e coocommerce non mi sono trovato male.