Il primo link potrebbe aiutarmi, solo che ogni colonna contiene più box di altezze che devono essere liberamente differenti in base ai contenuti.
Magari se riesco a mettervi una schermata della situazione, rendo meglio la problematica.
Sono pressoché convinto che senza JS non vado da nessuna parte in questo caso, ma JS sblocca tutti i div della pagina a scorrere, non soltanto quello main che contiene le tre colonne di box, e inoltre fa partire tutto con margin top = 0.