Sono indipendenti, sì.
Essendo la variabile X una sola, vorrei aggiungere un solo checkbox, più due bottoni A e B, che già ho. Quindi se io faccio A e voglio la variabile, premo A, spunto la casella e mi aggiunge al modello A creato la variabile. Se non la voglio non la spunto. E vale pure per B naturalmente.

Come si traduce in codice "dopo che premi A o B, se vuoi X seleziona la casella" ? :-)