Ma quindi non é una regola generale che la prima coppia di parentesi rappresenta l indice di riga e la seconda coppia l indice di colonna?
Non ne ho idea, ma in questo caso è esattamente il contrario.
I dati dentro una matrice (un array o quel che è) potresti definirli come meglio ti pare; l'importante è sapere come sono organizzati per poterli poi prelevare correttamente.
Non so dirti se esistono regole generali o altre convenzioni.