Ragazzi, non ho postato la soluzione adottato.

Ho utilizzando il comando robocopy con i seguenti parametri:
/E > permette di salvare nel folder di destinazione solo i file "piu' recenti" quindi quelli modificati
/PURGE > permette di eliminare nel folder di destinazione i file che non sono piu' presenti nel folder sorgente

Grazie a tutti per il supporto.