Ciao Cerza,
io utilizzo Illustrator CS6. Sopra i due riquadri di selezione dei colori per il riempimento e il contorno nel menu principale a sinistra, c'è l'icona per creare dei grafici vettoriali.
Copai e incolla i dati dal tuo file excel nella griglia di origine dei dati di Illustrator e il gioco è fatto.
A questo punto puoi salvare tranquillamente il file in eps o qualunque altro formato vettoriale tu preferisca.

* credo che questa funzione sia disponibile già dalla versione di Illustrator CS5.