In che senso sono riuscito a stampare solo un array?
Ti viene ritornato una array perchè, appunto, hai messo questa possibilità inserendo le parentesi quadre alla fine del nome dell'input.
Per recuperarli dipende cosa usi, POST o GET.

Se il nome dell'input è 'input_checkbox[]", e il metodo di invio del form è POST dovrai recuperare i valori della checkbox con $_POST[input_checkbox].

Ovviamente $_POST[input_checkbox] è un array perchè contiene tutte quelle checkbox che hai selezionato.