Codice PHP:
<?php $nome = 'Pippo'; ?>
<input type="text" value="<?php $nome ?>" name="nome">
Comunque se perdi i dati vuol dire che ricarichi la pagina, quindi perdi l'utilità di usare javascript, che si usa proprio per non ricaricare la pagina.
Stai sbagliando qualcosa nella logica dell'applicazione.