credo tu debba cambiare le query
dove vedi
Codice PHP:
$queryc = "SELECT  codice, ragione_sociale, indirizzo, indirizzo2, cap, citta, provincia,  piva, codice_fiscale, telefono FROM an_anagrafiche WHERE  idanagrafica='".$idcliente."'";
        $rsc = $dbo->fetchArray($queryc); 
nella select devi aggiungere i campi che ti servono
allo stesso modo sotto dove vedi
Codice PHP:
$c_codiceanagrafica = $rsc[0]['codice']; 
devi mettere delle righe in più con i nomi dei campi nuovi

infine nel codice
( $c_codiceanagrafica!="" ) ? $body = str_replace( '$c_codice$', $c_codiceanagrafica.",<br/>", $body ) : $body = str_replace( '$c_codice$', "", $body );
dovrai aggiungere i campi nuovi.
ma non stampando i risultati qua, non saprei dove/come aiutarti negli step successivi perchè questi dati poi li formatterà nel PDF...