difficile da dire cosi'....
Prima di tutto con SoapUI controlla che i WS siano funzionanti.
Controlla poi che i riferimenti ai WS nella applicazione migrata ci siano tutti ed andando in debug l'invoke funzioni, magari cercando di capire eventuali eccezioni con costrutti Try / Catch.
Poi dovresti dire esattamente la configurazione iniziale e quella attuale, possono essere tantissime cose...In generale si risolve FACENDO GENERARE A VISUAL STUDIO UN NUOVO WEB.CONFIG salvandoti le chiavi custom che avevi