Se per te questo è molto difficile vuol dire che devi studiare ancora le basi.
Non voglio offenderti, è proprio che se le cose stanno così ti stai avventurando in qualcosa oltre le tue possibilità e stiamo parlando comunque di una cosa semplice, quindi dovresti fermarti e studiare, altrimenti sarà un continuo chiedere "come si fa...?" e poi "non ho capito, mi fai un esempio?".
Così non si impara niente e si perde un casino di tempo.
Prenditi un libro o trova un buon sito dove insegnano ad usare PHP (meglio il libro), comincia dall'inizio, non saltare niente e non avere fretta, vedrai che il tempo che investi (non perdi, investi) nello studio lo recupererai con gli interessi quando ti metterai a sviluppare una tua applicazione, perché molte cose le saprai fare di tuo e non dovrai stare a scrivere su un forum, attendere una risposta, dire "non ho capito", aspettare un'altra spiegazione, ribadire "mi fai un esempio", aspetta ancora... e ancora... e ancora...
Sul forum ci potrai venire comunque a chiedere aiuto, ma avendo basi solide capirai al volo il consiglio che ti si da per risolvere il problema.
Provo a farti capire quanto sono basilari le domande che mi fai.
Mi chiedi "se nella mail devo inviare il link del sito piu il codice generato, devo fare un altra query per prendere l'email e poi spedire il messaggio"
Chiaramente no, l'utente si sta registrando, quindi la sua email l'ha inserita nel form di registrazione, ce l'hai nell'array $_POST, quello che viene ricevuto dallo script che esegue la registrazione, non c'è da andare sul DB.
Per la concatenazione tra indirizzo e codice, si tratta semplicemente di concatenare 2 stringhe, si fa con l'operatore . (punto).
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