Grazie mille della tempestiva risposta, ma io dovrei fare una classe chiamata appunto Inters e poi un tester, cioè IntersTester, nel quale l'utente attraverso il metodo Scanner inserisce i due Array i quali vengono confrontati dal metodo inters, il problema è che non riesco a far funzionare che:

if(uguali()) //se a1 e a2 hanno elementi ripetuti
allora il numero degli elementi ripetuti aumenta di 1

altrimenti continua il ciclo.