L'eccezione potrebbe essere scatenata per diversi motivi. Abituati a: debuggare vedendo in debug quale è l'eccezione, o al limite mettendo il print della eccezione, un banale System.out.println(e); o anche lo stacktrace completo con e.printStackTrace();
Se il problema è che non trova il file: la specifica "inputFile.txt" è relativa alla directory corrente. Quindi quale è la directory corrente devi saperlo tu o perlomeno averne il controllo (e dipende da come/da dove avvii la applicazione).