Tecnicamente dovresti fare:

codice:
<script type="text/javascript">
var codice='<?php echo md5($codice).'test'?>';
</script>

Cioè, usare php per generare il codice javascript.

Tieni presente però che quelle informazioni finiranno nel sorgente della pagina e saranno dunque facilmente recuperabili e questo, generalmente, rappresenta una vulnerabilità.

Anche la funzione md5 non andrebbe usata, ci sono alternative molto migliori per criptare.