Come già detto da me e ribadito da gibra... My.Resources non mi pare il posto più adatto per infilarci un .pdf.

Qualsiasi buon installer (io uso InnoSetup) non fallirà mai di inserire un file allegato dove gli dirai di inserirlo, e nessuno ti impedisce al lancio della applicazione di controllare che il file ci sia effettivamente ed eventualmente imporre una nuova installazione qualora esso sia stato cancellato.