C'e' un po' di confusione Lo script che hai indicato tu, il controllo dell'uplod è la parte in PHP lato server (quello che richiami presumo da front-end / Bootstrap). La risposta, sempre se non ho capito male la ricevi poi sul client/front-end via javascript .. o sbaglio?
Quando dici: utilizzo lo script file upload bootstrap cosa intendi esattamente? Io per bootstrap mi sto immaginando la libreria css/javascript ossia questa https://getbootstrap.com/ la quale potrebbe avere un qualcosa di già fatto che ti permette di fare appunto una chimata lato server con ajax per fare un upload.