Pare fosse un problema di conversione... Sapevo che, per non perdere qualità dell'immagine, occorreva rendere le immagini Oggetti avanzati, ma così facendo cancellandone porzioni venivano sostituite dal colore in primo o secondo piano (lo chiede proprio PS!); appena ho ricaricato l'immagine e rasterizzata, ho potuto procedere senza intoppi.
Devo comunque provare il tuo metodo. Per nuovo documento intendi un nuovo file .psd? E poi posso incorporare un documento in un livello di un altro file .psd?