Dovresti iterare sull'oggetto $rows che ottieni con la query, facendo attenzione di adattare il valore dell'id del campo hidden, tipo:

codice:
foreach($rows as $row) {
<input name="IDutente[]" type="hidden" id="IDutente_<?php echo $row['id'] ?>" value="<?php echo $row ['IDutente']; ?>
}