Prova questo. Senza alcuna garanzia.

Codice PHP:
<?php
function pippo(&$array) {
 
//---- Salva l'array come json per avere una stringa
 
$before json_encode($array);
 
//---- Ricerca del massimo
 
$max      0;
 
$arrMax   = array();
 foreach(
$array as $key => $subarray) {
  if (
count($subarray) == 0) continue;
  
$temp         max($subarray);
  if (
$temp $max$max $temp;
  
$arrMax[$key] = $temp;
 }
 
//---- Cancellazione degli array che non contengono il valore massimo
 
foreach($array as $key => $subarray) {
  if (
count($subarray) == 0) continue;
  if (
$arrMax[$key] != $max ) unset($array[$key]);
 }
 
//---- Cancellazione dei valori massimi
 
foreach($array as $key => $subarray) {  
  foreach(
$subarray as $key2 => $value) {
   if(
$value == $max) unset($subarray[$key2]);
  }
  
$array[$key] = $subarray;
 }
 
//---- Salva l'array come json per avere una stringa
 
$after json_encode($array);
 
//---- Se ci sono differenze tra prima e dopo si passa al passo successivo
 
if ($after != $before && count($array)>1pippo($array);
 
//---- Torna gli indici dei posti rimanenti => i migliori
 
$return = array();
 foreach(
$array as $key => $subarray$return[] = $key;
 return 
$return;
}
$array = array();
$array[0] = [1246];
$array[1] = [1256];
$array[2] = [126];
$array[3] = [1356];
$array[4] = [135];
$array[5] = [1356];
var_dump(pippo($array));