il fatto è che la prima colonna non è un campo, ma un aggregato. prova con una query nidificata, del tipo

codice:
SELECT presenze,
GROUP_CONCAT(DISTINCT squadra SEPARATOR '|') AS squadre
FROM (
SELECT COUNT(idsquadra) AS presenze,
squadre_SerieA.nome_squadra AS squadra
FROM campionati_SerieA
JOIN squadre_SerieA ON campionati_SerieA.idsquadra=squadre_SerieA.id_squadra
GROUP BY nome_squadra
)
GROUP BY presenze
ORDER BY presenze DESC