Inizialmente dovrai avere un checked di default per ogni gruppo altrimenti non stai seguendo gli standard di html.
Puoi usare le parentesi quadre dentro l'attributo name del form html e php trasforma in array.
name="name[]"
name="name[]" quando inviati tutti e due php crea la chiave iniziando da 0 name[0] o name[1] va anteposto $_POST avevamo detto crea un array, ovviamente lo farà in tale variabile quando il form è inviato con metodo POST.
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