Ciao, non so dirti se il mio consiglio possa risolvere comunque ti consiglio acquistare un certificato, lo potresti fare da te ma in questo caso non verrebbe depositato.
Così facendo all'avvio Windows dirà che il software proviene da fonte attendibile. Mostrerà poi i riferimenti aziendali.
Consiglio che il certificato di firma con cui firmerai l'eeguibile coincida con quello del programma principale.
Per firmare l'eseguibile si usa una apposita utility dell'sdk di Windows.