Non ho ben capito il discorso del colore blu ovunque, cioè se lo vedi su dreamweaver o sulla preview da browser.
Per il discorso dell'allineamento del menu potresti:

1) Verificare che il browser sia aggiornato.
2) Provare ad utilizzare i webkit per autmentare la compatibilità con browser vecchi, tipo:
codice:
display: -webkit-flex;
display: flex;
-webkit-justify-content: end;
justify-content: end;
ps. che versione ha dreamweaver ?