Leggiti la FAQ 1.16, c'è scritto tutto quello che devi fare.

https://docs.phpmyadmin.net/en/lates...meout-problems

In alternativa, prova a comprimere l'SQL e caricare la versione compressa o splittalo in più file per bypassare il problema.

Infine, se il MySQL è accessibile dall'esterno, puoi importarlo direttamente da linea di comando con mysql