Ciao, da quel che so le due cose girano in modo indipendente l'una dall'altra; a meno che le due cose non siano volutamente collegate, non mi risulta che una chiamata AJAX, quale essa sia, possa influire sulla transizione di dati eseguita con un altro form, quale esso sia.

Piuttosto, sei sicuro di aver scritto correttamente il markup del form?
A volte capita di fare banali errori di battitura difficili da vedere ma che possono compromettere il normale comportamento delle cose.

Puoi postare esattamente ciò che hai scritto per l'intestazione HTML del tag form?

Inoltre, il submit viene eseguito in modo tradizionale o, per qualche ragione, viene dato in pasto a JavaScript?
Sai, magari per validare i campi è possibile che venga interrotto il submit per poi essere rieseguito programmaticamente.
In tal caso non vorrei che per qualche ragione prima del submit sia impostato il GET via JavaScript.