Questo significa che una parte (quasi tutto) del sistema operativo (durante l'installazione) si è scritta sul HDD; questo perchè era più grande del SSD.
La regola impone, durante l'installazione di un OS, di tenere attaccato solo il disco dell'installazione. Va staccato tutto il resto: dischi secondari ed anche supporti per le memory (che vanno ad alterare le lettere dei dischi)
Una volta installato il sistema si attacca tutto il resto.
A te è accaduto questo ed ora non potrai più recuperare l'errore perchè non c'è nulla da recuperare.
Il boot è scritto sul disco C: ma cerca il sistema probabilmente sul disco E: che non esiste.
E' un comunissimo errore per chi fa da se con poca esperienza.
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