Ciao, senza alcuna offesa, trovo il sistema molto artigianale e poco "amichevole" (poco pratico nell'utilizzo).
A parte il problema descritto, noto diversi altri problemi nella logica di funzionamento.

Prima di andare a cercare di risolvere, vorrei capire meglio il contesto e il reale tuo obiettivo.
Se si tratta di un "esercizio", o qualcosa del genere, a scopo di studio personale, posso capire la decisione di aggiustare quello script.
Se invece intendi ottenere uno strumento ottimale da usare poi nella pubblicazione di qualche tuo progetto, sarebbe forse più pertinente cercare qualcosa di già pronto.

In quest'ultimo caso potrei consigliarti di effettuare qualche ricerca del tipo "javascript image cropper plugin"; con una opportuna cernita potrai trovare diversi plugin/snippet personalizzabili da includere nei tuoi elaborati.
Non so se per te possa essere una valida alternativa. Fai sapere.