Spero di aver capito bene la tua richiesta...

se vuoi lanciare un .EXE (VB)
e far si che venga lanciato ridotto
ad icona basta che nel FORM di start-up
setti la proprietà WindowState su "minimized"

oppure da codice, nell'evento FORM_Load() scrivi

FORM1.WindowState=1 ' 1 corrisponde a minimized