Inserisci nella PATh o nelle Variabili d'Ambiente il percorso di javac.exe così lo puoi usare dappertutto.

Per compilare:

javac nome_file.java

Il Manifest serve per creare i .jar

Digita jar per vedere come fare a creare il .jar

Il Manifest è questo:

Manifest-Version: 1.0
Main-Class: Main
Created-By: 1.4.1 (Sun Microsystems Inc.)

Inserisci il nome della Tua Main-Class e della Versione con la quale hai Sviluppato l'Applicazione...