Cosa significa un punto ben preciso di B?
Non puoi aprire un file e scriverci nel mezzo, al massimo puoi caricare in memoria il contenuto del file B fino al punto indicato, caricare in memoria tutto A e poi il rimanente di B.
Alla fine salvi tutto su un file (eventualmente lo stesso B).

E' questo quello che vuoi ottenere? Se si, come specifichi il punto in cui inserire A?