File->Importa

ed importi il file .swf generato dal programma (Plasma, Swift o altro che sia)

Considera però che l'animazione viene importata come una sequenza di keyframe, quindi in alcuni casi la modifica potrebbe richiedere un po' di tempo se devi rieseguirla su ogni fotogramma, secondo me ti conviene fare direttamente dal programma di grafica 3d l'animazione esattamente come la vuoi (o almeno il più simile possibile), in modo da dover fare un numero di modifiche relativamente ridotto da Flash