Potresti innanzitutto collegarti alla macchina con MSDE utilizzando l'Enterprise Manager che hai sull'altro server (quello con SQL server 2000).
Per quanto riguarda il nuovo database, spiegati meglio per favore; cioè il db che vuoi inserire (i file mdf e ldf) è presente sul server sql 2000 ? Allora potresti usare il wizard di copia db da una macchina all'altra.
Fai attenzione che non è possibile copiare semplicemente i file (mdf e ldf) da un server all'altro. Devi usare le stored procedure sp_detach_db e sp_attach_db per "sganciarli" da un server e "riagganciarli" ad un altro.
Dammi qualche dettaglio in più perchè possa aiutarti