non ho mai provato a fare una cosa così, ma secondo me puoi risolverla in questo modo:

ti crei un fotogramma per ogni swf esterno, in ogni fotogramma ti crei un mc con un nome univoco che ti carica un determinato filmato e dal menu ti mandi semplicemente al fotogramma che ti interessa.....è una soluzione abbastanza banale e forse poco ottimale, ma dovrebbe funzionare