basta crearti una query che esegua i comandi T-SQL che facciano in ordine:
Creare il db
creare le tabelle del db
copiare eventuali dati dalle tabelle MySQL a quelle appena create.

una volta fatto questo script lo esegui come text di un command e lanci l'execute della connection sul server SQL

codice:
MioComando.CommandTex= SCRIPT
MiaConnection.Execute(MioComando)