Che ad esempio per un portale di grosse dimensioni non è certo comodissimo usare Flash, tanto per dirne una

Puoi volendo evitare la 'versione alternativa' in un sito flash, questo sì (ma il sito flash dev'essere comunque abbastanza leggero, altrimenti chi ha il 56 k potrebbe stufarsi in caso di tempi ti attesa lunghi)

Tanto per dirne un paio
Insomma, direi che non puoi pensare di 'evitare' di studiare html,javascript,etc.. solo perchè il player flash ha una buona diffusione
E' vero che ormai siti di un certo tipo solo in html non ce ne sono molti, ma anche usando linguaggi server-side, l'output dev'essere comunque in html (o in xhtml), quindi conoscerlo non guasta, poi è molto facile da imparare