usa class diversi per gli input abilitati e per quelli disabilitati

.inputEnabled{
color: #cccccc;
....
}

.inputDisabled{
color: #aaaaaa;
....
}

poi se alcuni campi vengono abilitati nel corso dell'utilizzo del form
da javascript sostituisci il class disabled con quello enabled con:

document.forms.tuoForm.elements.tuoCampoInput.clas sName = "inputEnabled"