Lo script che sto preparando non viene eseguito da Apache (anche se potrebbe non è consigliabile) ma direttamente dall'interprete php CLI o CGI.

Non noto particolari problemi di affaticamento, tanto più che nel mio caso qmail si trova su una macchina che non è la stessa che serve le pagine WEB del sito, per ogni evenienza faccio partire l'invio nelle ore della sera (quando nessuno usa la macchina) attraverso un cronjob.

Se per qualche ragione devi far eseguire lo script da Apache allora segui il consiglio di Lenna e suddividi il blocco gruppi più piccoli e dilaziona gli invii nel tempo. Ti servirà comunque cron.