In realta`, per come li definisci sono stringhe.
Per trasformarli in numeri puoi usare parseInt() o parseFloat(), a seconda se sono numeri interi o decimali:
var PrezzoUni = parseFloat(document.myform.elements['PREZZO'+idd].value);
var Qta = parseInt(document.myform.elements['QTA'+idd].value);
var Tot = Math.round((PrezzoUni*Qta)*100)/100;
document.myform.elements['Netto'+idd].value = Tot;
Ho anche anticipato la tua prossima domanda sull'arrotondamento (ma se ti interessa imparare, non tener conto delle ultime righe e prova prima ad inserire solo parseInt() e parseFloat() ).
Ciao
Michele