Nell'else (che dovrebbe comprendere tutti i browser tranne IE vecchio) mettici:

parent.ShopFrameBottom.location.href = indFrameBottom;

Questa sintassi dovrebbe funzionare con tutti i browser, per cui potresti eliminare tutti gli if:

function LoadShop(msgMiddle, indFrameBottom, language) {

parent.ShopFrameMiddle.location.href = '../dinam/ShopFrameMiddle.asp?msg=' + msgMiddle + '&lan=' + language;

parent.ShopFrameBottom.location.href = indFrameBottom;
}

Ciao
Michele