il pezzo che cerchi è:

// isolo l'estensione
extFile=nomeFile.substr(nomeFile.lastIndexOf(".")+ 1);
// verifico che sia fra quelle permesse
permesse="#jpg#gif#bmp#";
if (permesse.indexOf("#"+extFile+"#")==-1) {
alert(extFile + " non e' un file permesso");
}

controlla se l'estenzione del file è lecita.
Per verificare che tipo di estensione, basta che usi extFile, ad esempio:

alert(extFile)

ciauzz