sei un po' off topic.. cmq i chmode li imposti direttamente sul server... fai l'upload e poi con qualsiasi programma ftp puoi cambiare i chmode... se hai un pannello di controllo sul server come cpanel ad esempio.. lo puoi fare anche da lì... altrimenti se non vuoi usare ptrogrammi ftp ma usare IE per questo... ti puoi fare tu stesso in PHP un semplice pannello per settare i chmode