Personalmente ho sviluppato poche applet e quindi ho sempre usato il tag APPLET e non ti so dire nulla sulla sua obsolescenza. Comunque io continuo a vedere ancora un sacco di siti che usano APPLET al posto di OBJECT.

Per quanto riguarda la comunicazione con ASP,PHP o JSP sono sicuro che e' possibile quella con JSP (anche se il meccanismo di comunicazione non lo conosco, ma posso andarlo a recuperare) mentre escluderei ASP e PHP.