molto probabilmente dipente da come hai fatto l'upload!
devi settare la modalità BIN prima
per saperne di piu'..
vai nel dos:
digita FTP

poi fai:
OPEN FTP.xxxxx.it
user
password

HELP (ti da i comandi ftp)
BIN (modalita' binaria di trasferimento..altrimenti sono files di testo)

cd ..... (cambia cartella ecc... )