No, non importerei il file txt in access ma elaborerei il file sequenziale per un primo controllo formale dei barcode (e/o altri campi) e solo a controllo superato testo se il barcode esiste in tabella, se non esiste lo inserisco altrimenti lo segnalo come barcode doppio.
Chiaramente le strade sono molte, puoi benissimo imporate il file in access e con una query evidenziare i barcode doppi ma eviterei questo metodo in quanto importeresti anche le informazioni errate.
Ciao