secondo me sì, l'importante e che riesci attraveso gli include o gli argomenti delle funzioni(se hai programmato con queste) a dare un title e description univoco a tutte le pagine, qualcuno dice che non vengano graditi i parametri eccessivamente lunghi, o che a volte non amino ?id=1 in quanto li scambiano x un ID di sessione e non li indicizzano. C'è qualcuno che però ribadisce che in ogni caso una pagina.html sia favorita. Cmq ci sono dei tool free che ti simulano lo spider, prova a testare il tuo sito con quello.
In definitiva,una pagina php senza parametri esagerati non ha grossi problemi.