Ciao Kevin,

per manipolare la select nell'opener dalla popup dovresti mettere nell'opener la funzione di inserimento
codice:
function Aggiungi(testo,valore){
  oo = document.form_gruppi.GRUPPO.options
  oo[oo.length]=new Option(testo,valore)
}
e usarla dalla popup
codice:
function AggiungiOpener(theForm,check){
  mamma = window.opener
  cc=document.forms[theForm].elements[check]; 
  if(cc.length){ 
    for (var i=0;i<cc.length;i++){ 
      var e = cc[i]; 
      if(e.checked){ 
        var dat = e.value.split("-"); 
        mamma.Aggiungi(dat[0],dat[1]);
      } 
    } 
  } else { 
    if(cc.checked){ 
      var dat = e.value.split("-"); 
      mamma.Aggiungi(dat[0],dat[1]);
  } 
}
queste funzioni le ho fatte qui al momento... prova e famme sape'