JAVA è una cosa, JavaScript è un'altra!!
che linguaggio vuoi usare?

JAVA è un linguaggio lato server!!
JavaScript è lato client!!

Se il contatore è globale(conta tutti gli utenti che si nono collegati) credo che dovresti utilizzare JAVA con il supporto di un DB

Se il contatore è relativo(conta gli accessi di un determinato utente) puoi farlo con JavaScript, un esempio e a questo link:

http://www.the-cool-place.co.uk/java...ndpaste16.html
oppure:
http://www.webreference.com/js/tips/000330.html