Ciao!
io ho il tuo stesso problema!
ho creato un layout in css ma se mi va bene in explorer non mi va in netscape! Ho risolto un po' tentando di rendere il codice + pulito ma rimane sempre il problema che i diversi tag html vengono letti in maniera diversa...pur facendo <div>ciao<div/>....è una cosa che non capisco ma anche i tag<a> rischiano di sballare la posizione del contenuto!
L'unica soluzione forse è un js per il riconoscimento dei vari browser e a seconda del tipo richiami il foglio di stile.
Sinceramente io ci ho rinunciato arrivando al compromesso....cioè rendere il sito almeno almeno navigabile con netscape!
Per esempio il tag

</p> se al suo interno non mettiamo nulla come in quetso caso Ie lo legge come se non vi fosse nulla mentre Netscape come se all'interno abbia uno spazio!
Ho fatto tutti i tentativi possibili ma credo ci sia poco da fare!
Comunque credo di aver capito che non c'entra nulla il bug del box model...ancora di + se pensi che uso IE 6 e NT 7.0!
Ti ripeto l'unico modo che penso sia valido è js che riconosce il browser + 2 css da associare!!!
Nel caso trovassi la soluzione fammi un fischio!