Io avevo risolto inserendo un div largo tutta la pagina e bassissimo alla fine di ogni riga (vedi il mio sito).

Pero` lo sfondo era uguale, per cui non so se questo consiglio ti puo` andar bene.
In alternativa dovresti provare a mettere ogni coppia di div affiancati dentro un altro div, in modo che le altezze risultino uguali.

Ciao
Michele